Sept régions de Suisse ont été choisies sur lepido.ch pour permettre des recherches avec la distribution des espèces : Jura, Plateau, Préalpes et Alpes du Nord, Alpes Centrales de l’Ouest, Alpes Centrales de l’Est, Alpes du Sud et Sud du Tessin.
Ces régions sont les mêmes que celles considérées dans « Les régions biogéographiques de la Suisse » (Gonseth et al. 2001), qui sont détaillées sur l’illustration ci-dessous. Cette illustration présente également l’ensemble des termes géographiques utilisés sur lepido.ch, qui suit aussi les noms utilisés par Météosuisse pour nommer les régions de Suisse (cf. ce lien).